Les donnees T2/PD sont acquises d'une facon fusionee au depart en 8 volumes dont le premier commence de location (coordonnees Talairach) a peu pres de x = -68 et le 8ieme commence a x = -76. Si les donnees etaient obtenus de facon 'normal' de l'INM: Les valeurs 'x' augmente de cote gauche a cote droite, 20 coupes aux intervalles de 8 mm Les valeurs 'z' augmente de l'inferieure a superieure, 256 coupes aux intervalles de 1 mm Les valeurs 'y' augmente de posterieure a anterieure, 256 coupes aux intervalles de -1 mm On peut verifier le contenu d'un fichier T2/PD avec mincinfo: $> mincinfo ld-r526-sonatavision-16505-20021102-102142-6-mri.mnc file: ld-r526-sonatavision-16505-20021102-102142-6-mri.mnc image: signed__ short 0 to 4095 image dimensions: echo_time xspace zspace yspace dimension name length step start -------------- ------ ---- ----- echo_time 2 unknown unknown xspace 20 8 -67.8841 zspace 256 -1 129.353 yspace 256 -1 181.43 Pour chaque fichier T2/PD (ayant les specifications tel qu'indique en haut), on separe les donnees avec mincreshape: $> mincreshape -dimrange echo_time=0 nom_de_sujet_run_number_etc.mnc nom_de_sujet_run_number_pd.mnc $> mincreshape -dimrange echo_time=1 nom_de_sujet_run_number_etc.mnc nom_de_sujet_run_number_t2.mnc Des que les donnees ont ete separees, on cree soit un fichier pd, soit un fichier T2 avec: $> concat_mri nom_de_sujet_*_pd.mnc nom_de_sujet_pd.mnc ou $> concat_mri nom_de_sujet_*_t2.mnc nom_de_sujet_t2.mnc selon le cas.